Au début des années 1990, sous l’impulsion de l’ISEC (Organisme de gestion des collèges et lycées catholiques), apparaît l’idée d’une nouvelle école catholique sur le Pays des Olonnes. La Direction Diocésaine de l’Enseignement Catholique après consultations et études démographiques apporte son soutien à l’opération. Le site d’implantation choisi est le terrain inutilisé du collège Amiral.

En 1994, une première tranche de travaux conduit à l’ouverture d’une classe maternelle avec 33 élèves, rattachée administrativement, pour des raisons de contrat avec l’État, à l’école Saint-Paul du Château-d’Olonne.       
    
C’est en 1995 que l’école devient autonome avec l’ouverture d’une deuxième classe. Elle prend alors le nom d’école « Amiral » et est dirigée par Isabelle Couton.

La poussée démographique et les demandes d’inscription sont telles qu’il faut envisager rapidement la construction de classes supplémentaires. Au printemps 1996, trois classes avec un préau sont construites.

En septembre 1997, 124 élèves font leurs rentrées dans les cinq classes de l’école, de la maternelle au CM1.

L’école s’avère encore trop petite et il faut solliciter les locaux du collège pour assurer la garderie.

En 1998, une 6^e classe (CM2) voit le jour mais elle doit fonctionner, faute de place, dans l’une des salles de classe du collège. En 1999, un bloc de trois classes préfabriquées viennent compléter la structure. Une 7^e classe s’ouvre en septembre 1999 puis en septembre 2000, une 8^e classe.